Большой перепад рельефа (около 15 метров), а также крайняя стесненность участка обусловили сложность и нетрадиционность архитектурного решения. Поставленные друг напротив друга корпуса начальной и средней школы формируют внутренний двор, здесь же оказывается естественный амфитеатр, подходящий для проведения общешкольных мероприятий.

Общественные зоны, включающие в себя вестибюль, гардеробы, столовую, администрацию и актовый зал, из-за нехватки озелененных территорий пришлось частично заглубить в рельеф, обеспечив доступ дневного света при помощи остекленного атриума. Дополнительные связи внутришкольных пространств — две галереи, в местах их стыка с корпусами образованы рекреационные зоны. Там же — дополнительные помещения, выходящие за рамки стандартной функциональной программы школы. В своеобразной петле, по структуре и образу напоминающей молекулу ДНК, размещены выставочные пространства, мобильный лекторий, интернет-кафе и планетарий.